Brigitte Mukengeshayi est chargée de mission et collabore aux travaux thématiques de la Commission Européenne sur l'agenda de localisation du Grand Bargain, la révolution participative, le G7 et le G20. Avant de rejoindre le secteur de l'élaboration des politiques, elle a travaillé comme desk officer en charge de l'aide humanitaire à Haïti et dans plusieurs pays d'Asie du Sud.
Avant son parcours à la DG ECHO, elle a occupé différentes missions dans le domaine interinstitutionnel, notamment les relations entre la Commission et le Conseil européen, le Parlement européen et les parlements nationaux pendant son séjour à la DG Environnement et à la DG CLIMA.